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　　微波萃取的機理可從兩方面考慮，一方面微波輻射過程是高頻電磁波穿透萃取介質，到達物料的內部維管束和腺胞系統。由于吸收微波能，細胞內部溫度迅速上升，使其細胞內部壓力超過細胞壁膨脹承受能力，細胞破裂。細胞內有效成分自由流出，在較低的溫度條件下萃取介質捕獲并溶解。通過進一步過濾和分離，便獲得萃取物料。
　　
　　另一方面，微波所產生的電磁場加速被萃取部分成分向萃取溶劑界面擴散速率，用水作溶劑時，在微波場下，水分子高速轉動成為激發態，這是一種高能量不穩定狀態，或者水分子汽化，加強萃取組分的驅動力；或者水分子本身釋放能量回到基態，所釋放的能量傳遞給其他物質分子，加速其熱運動，縮短萃取組分的分子由物料內部擴散到萃取溶劑界面的時間，從而使萃取速率提高數倍，同時還降低了萃取溫度，zui大限度保證萃取的質量。
　　
　　還有的文獻是這樣描述的：由于微波的頻率與分子轉動的頻率相關連，所以微波能是一種由離子遷移和偶極子轉動引起分子運動的非離子化輻射能。當它作用于分子上時，促進了分子的轉動運動，分子若此時具有一定的極性，便在微波電磁場作用下產生瞬時極化，并以2.45億次/秒的速度做極性變換運動，從而產生鍵的振動、撕裂和粒子之間的相互摩擦、碰撞，促進分子活性部分（極性部分）更好地接觸和反應，同時迅速生成大量的熱能，促使細胞破裂，使細胞液溢出來并擴散到溶劑中
　　
　　微波萃取與其他萃取技術相比的優勢：
　　
　　一、微波萃取：微波提取技術是利用微波的反射、穿透及吸收等特性及熱效應和滲透速度快的特點，將藥物組織和細胞中的生理活性物質通過破壁提取出來，提取時溫度低,能有效保護物料中有效成份的流失；提取物純度高，無污染、溶劑用量少，節約投資，是現在中藥現代化中理想的提取設備。
　　
　　二、其它萃取：常規提取與索氏提取，主要以熱傳導、由外向內進行加溫，從而產生熱梯度；由于提取時溫度較高，不能有效的保護物料中的熱敏性物質，而且2－3次才能提凈；提取物純度低、能耗高、有污染、易于糊化、投資費用高等缺點。
　　
　　濟南鑫弘微波設備有限公司是一家以微波應用設備的研發、銷售、設計、生產、服務為一體的微波能應用設備研發生產型*企業。本公司采用*技術，按GMP、FDA標準生產制造915MHZ、2450MHZ兩大系列工業微波設備，各項技術指標均達到*水平，微波高溫燒結技術、高溫固相合成技術處于世界水平。可為冶金、化工、醫藥、食品、木材等領域提供快速、節能、率的微波干燥、微波殺菌、微波烘干、微波脫水、微波萃取、微波加熱、微波燒結等工藝設備。同時承擔各種應用試驗、中試放大生產及的技術咨詢和服務。